Kunarac će se suočiti sa suđenjem pred pravosudnim tijelima BiH zbog novih optužbi za ratne zločine počinjene u istočnom dijelu zemlje. Tužilaštvo BiH tereti Kunarca za navodne ratne zločine počinjene 1992. godine na području Foče, uključujući ubistva najmanje šest civila bošnjačke nacionalnosti, za što nije odgovarao pred haškim sudom. Takođe, optužen je za mučenja, deportaciju civila bošnjačkog naroda te uništavanje imovine, uključujući paljenje kuća. Zločini su počinjeni u okviru progona i etničkog čišćenja bošnjačkog stanovništva, a Kunarac je bio zapovjednik specijalne jedinice „Žaga“ Vojske Republike Srpske.
Kunarac je inače 2002. godine osuđen pred Haškim tribunalom na 28 godina zatvora za zločine počinjene u Foči 1992. godine kada je kao zapovjednik specijalne jedinice Vojske Republike Srpske sudjelovao u brojnim zločinima protiv bošnjačkog civilnog stanovništva. Kunarac je postao prvi optuženik koji je pred haškim tribunalom osuđen za silovanje i mučenje bosanskih muslimanki.
Pored silovanja Kunarac je bio odgovoran i za druge zločine u Foči, uključujući paljenje kuća i imovine te deportaciju bošnjačkog stanovništva. Prema optužnici, njegova jedinica je bila ključna u provođenju zločinačkih aktivnosti u tom području, a mnoge žrtve su bile civili, koji su bili brutalno mučeni, silovani i ubijeni.
